One of our key research themes is on extremophilic microorganisms, particularly the biodiversity of bacterial and archaeal communities in volcanic and desert ecosystems. Metagenomics, comparative genomics, and phylogenomics are among the approaches that we employ to study poorly researched lineages and decipher molecular adaptations to extreme environments.
Our work also includes other research models, like insects and arthropods. We analyze microbial diversity, function, and coevolution using metagenomics, phylogenomics and functional approaches. Using comparative genomics and genotaxonomy, we study the diversity and functional capacity of rhizobia, with particular emphasis on symbiosis, nodulation, and biological nitrogen fixation genes. Recently, microbial diversity in soils has been investigated through metagenomics. We aim to detect genes related to antimicrobial resistance and to explore their environmental and health implications.
In the group, we employ methodologies such as comparative genomics, metagenomics, construction of MAGs, amplicon analysis, phylogenomics, and high-throughput sequence data processing. These are helpful in assembling genomic, ecologic, and evolutionary data in order to achieve insights into microbial diversity and function within complex biological systems.
Uno de los temas clave de nuestra investigación son los microorganismos extremófilos, en particular la biodiversidad de las comunidades bacterianas y de arqueas en ecosistemas volcánicos y desérticos. Para estudiar linajes poco investigados y descifrar las adaptaciones moleculares a entornos extremos, empleamos enfoques como la metagenómica, la genómica comparativa y la filogenómica.
Nuestro trabajo incluye a otros modelos de investigación, como lo son los insectos y los artrópodos. Estudiamos la diversidad, la función y la coevolución microbianas mediante enfoques metagenómicos, filogenómicos y funcionales. Mediante genómica comparativa y genotaxonomía, estudiamos la diversidad y la capacidad funcional de los rizobios, con énfasis en los genes de simbiosis, nodulación y fijación biológica de nitrógeno. Recientemente, estamos investigando la diversidad microbiana de suelos mediante metagenómica. Nuestro objetivo es detectar genes relacionados con la resistencia a antimicrobianos y estudiar sus implicaciones medioambientales y para la salud.
En el grupo, empleamos métodos de genómica comparativa, metagenómica, construcción de MAGs, análisis de amplicones, filogenómica y el procesamiento de datos de secuenciación masiva. Estas metodologías son útiles para recopilar datos genómicos, ecológicos y evolutivos con el fin de obtener información sobre la diversidad y la función microbianas dentro de sistemas biológicos complejos.
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